MULTIPLEX PCR
Aynı reaksiyon içerisinde birden fazla oligonükleotid primer çifti kullanılarak DNA zinciri üzerindeki birden fazla hedef bölgenin aynı anda çoğaltılması işlemidir. Genellikle gen içerisindeki delesyon (örneğin DMD Duchenne Müsküler Distrofi) mutasyonlarının analizinde kullanılmaktadır. Multiplex PCR’da dikkat edilmesi gereken en önemli nokta, hedef DNA bölgeleri için primer çiftleri tasarlarken amplifiye olacak olan fragment büyüklüklerinin farklı olmasıdır.